Hei ada! Sebagai pembekal FMOC - beliau - AIB - OH TFA, saya sering bertanya tentang kemungkinan yang mungkin - reaksi kompaun ini. Jadi, saya fikir saya akan menulis blog ini untuk berkongsi beberapa pandangan mengenai perkara itu.
Mula -mula, mari kita dengan cepat memahami apa yang FMOC - nya - AIB - OH TFA. FMOC bermaksud fluorenylmethyloxycarbonyl, yang merupakan kumpulan perlindungan biasa dalam sintesis peptida. Nya adalah histidin, asid amino penting. AIB adalah α - asid aminoisobutrik, asid amino proteinogenik yang tidak dapat memberikan sifat struktur yang unik kepada peptida. Dan TFA adalah asid trifluoroacetic, yang sering digunakan dalam langkah -langkah pelepasan sintesis peptida.
Pelepasan - tindak balas sampingan yang berkaitan
Salah satu senario yang paling biasa di mana tindak balas sampingan boleh berlaku adalah semasa pelepasan kumpulan FMOC. Kumpulan FMOC biasanya dikeluarkan menggunakan asas, biasanya piperidine. Walau bagaimanapun, dalam keadaan tertentu, beberapa tindak balas yang tidak diingini boleh berlaku.
Pengubahsuaian histidin
Histidine mempunyai rantaian imidazole, yang agak reaktif. Semasa pelepasan asas kumpulan FMOC, terdapat risiko histidin mendapat alkylated atau diubah suai. Persekitaran asas boleh menyebabkan nitrogen imidazole bertindak balas dengan kekotoran atau spesies reaktif lain dalam campuran tindak balas. Sebagai contoh, jika terdapat jumlah alkil halida yang hadir, rantaian histidin - rantai boleh menjalani tindak balas alkilasi, yang membawa kepada produk yang diubahsuai.
AIB - Reaksi Berkaitan
α - Asid aminoisobutrik (AIB) agak istimewa kerana kumpulan metilnya yang besar. Kumpulan metil ini kadang -kadang boleh menyebabkan penghalang sterik semasa proses pelepasan. Dalam sesetengah kes, asas mungkin tidak dapat mengakses kumpulan FMOC dengan mudah, yang membawa kepada pelepasan yang tidak lengkap. Dan jika keadaan tindak balas terlalu keras untuk memaksa pelepasan, ia boleh menyebabkan reaksi lain - seperti racemization residu AIB. Racemization bermaksud bahawa pusat kiral asid amino AIB boleh terbalik, mengakibatkan campuran stereoisomer yang berbeza.
Reaksi gandingan
Apabila FMOC - His - AIB - OH TFA digunakan dalam sintesis peptida, tindak balas gandingan dijalankan untuk menghubungkannya dengan asid amino lain. Reaksi gandingan ini biasanya dimediasi oleh agen gandingan seperti HBtu (O - benzotriazole - N, N, N ', N' - Tetramethyl - uronium - Hexafluoro - fosfat) atau DIC (N, N ' - Diisopropylcarbodiimide).
Sisi Histidine - Gangguan Rantai
Rantai histidine - boleh mengganggu tindak balas gandingan. Kumpulan imidazole boleh bertindak sebagai nukleofil dan bertindak balas dengan ejen gandingan atau asid amino yang diaktifkan. Ini boleh membawa kepada pembentukan produk oleh - seperti penambahan agen histidine - gandingan. Tambahan ini kemudiannya boleh bertindak balas dengan cara yang tidak dijangka, yang membawa kepada campuran produk yang kompleks.
Kesan sterik AIB
Seperti yang dinyatakan sebelum ini, sebahagian besar sterik AIB juga boleh menjejaskan tindak balas gandingan. Kumpulan metil yang besar boleh membuat sukar bagi ejen gandingan untuk mendekati kumpulan karboksil AIB dan membentuk ester yang diaktifkan. Ini boleh menyebabkan hasil gandingan yang lebih rendah dan masa tindak balas yang lebih lama. Dan jika tindak balas dipaksa untuk selesai dengan meningkatkan masa tindak balas atau jumlah ejen gandingan, ia dapat meningkatkan risiko reaksi sampingan, seperti pembentukan diketopiperazin. Diketopiperazines adalah dipeptida kitaran yang boleh membentuk apabila kumpulan amino dan karboksil dua asid amino bersebelahan bertindak balas secara intramolecularly.
Asid - Reaksi sampingan yang berkaitan
Oleh kerana TFA sering terlibat dalam proses sintesis, reaksi sampingan asid - juga menjadi kebimbangan.
TFA - belahan pengantara
TFA digunakan untuk pelepasan akhir kumpulan perlindungan rantaian dalam sintesis peptida. Walau bagaimanapun, ia juga boleh menyebabkan beberapa tindak balas belahan yang tidak diingini. Sebagai contoh, jika keadaan tindak balas terlalu berasid atau masa tindak balas terlalu panjang, TFA boleh memadamkan ikatan peptida antara HIS dan AIB. Ini boleh menyebabkan pembentukan serpihan peptida yang lebih pendek dan penurunan hasil keseluruhan produk yang dikehendaki.
Protonasi histidin
Kumpulan imidazole histidin boleh diprotoni oleh TFA. Walaupun ini biasanya merupakan proses yang boleh diterbalikkan, dalam beberapa kes, histidin protonasi boleh bertindak balas dengan spesies lain dalam campuran tindak balas. Sebagai contoh, ia boleh bertindak balas dengan air atau nukleofil lain yang terdapat dalam larutan, yang membawa kepada pembentukan derivatif histidin yang diubahsuai.
Cara meminimumkan sampingan - reaksi
Untuk meminimumkan reaksi sampingan ini, penting untuk mengawal keadaan reaksi dengan teliti. Untuk pelepasan kumpulan FMOC, menggunakan kepekatan asas asas dan masa tindak balas yang sesuai adalah penting. Ia juga merupakan idea yang baik untuk membersihkan reagen dan pelarut untuk mengurangkan kehadiran kekotoran yang boleh menyebabkan reaksi sampingan.
Ketika datang ke reaksi gandingan, memilih ejen gandingan yang tepat dan mengoptimumkan keadaan reaksi dapat membantu. Sebagai contoh, menggunakan ejen gandingan yang lebih selektif dan kurang reaktif ke arah rantaian histidin boleh mengurangkan pembentukan produk. Dan untuk langkah -langkah TFA yang ditengah, mengawal kepekatan asid dan masa tindak balas dapat menghalang reaksi belahan yang tidak diingini.
Sebatian yang berkaitan
Jika anda bekerja dalam sintesis peptida, anda mungkin juga berminat dengan beberapa sebatian yang berkaitan. Contohnya,Fmoc - thr (tbu) - phe - ohadalah satu lagi pertengahan penting dalam sintesis peptida. Ia mempunyai kombinasi asid amino dan kumpulan pelindung yang berbeza, yang boleh menawarkan sifat dan kereaktifan yang berbeza berbanding dengan FMOC - His - AIB - OH TFA.
Sebatian lain yang berkaitan adalahBOC - HIS (TRT) - AIB - OH. Kumpulan BOC adalah satu lagi kumpulan pelindung biasa, dan kumpulan TRT (trityl) digunakan untuk melindungi rantai histidin. Kompaun ini boleh digunakan dalam strategi sintetik yang berbeza di mana kumpulan BOC lebih disukai daripada kumpulan FMOC.
DanBOC - His (TRT) - AIB - Glu (Otbu) - Gly - OHadalah peptida yang lebih kompleks. Ia mengandungi pelbagai asid amino dan kumpulan pelindung, yang boleh digunakan dalam sintesis peptida yang lebih panjang dan lebih kompleks.
Kesimpulan
Kesimpulannya, FMOC - His - AIB - OH TFA adalah sebatian yang berguna dalam sintesis peptida, tetapi ia dilengkapi dengan reaksi sampingan yang berpotensi. Memahami reaksi sisi ini dan bagaimana untuk meminimumkannya adalah penting untuk mendapatkan peptida berkualiti tinggi.
Jika anda terlibat dalam sintesis peptida dan berminat untuk membeli FMOC - His - AIB - OH TFA atau mana -mana sebatian yang saya nyatakan, jangan ragu untuk menjangkau perbincangan perolehan. Kita boleh bercakap tentang kuantiti yang anda perlukan, keperluan kualiti, dan pilihan harga terbaik.
Rujukan
- Chan, WC, & White, PD (2000). Sintesis peptida fasa pepejal FMOC: Pendekatan praktikal. Oxford University Press.
- Bidang, GB, & Noble, RL (1990). Sintesis peptida fasa pepejal menggunakan 9 - fluorenylmethoxycarbonyl asid amino. Jurnal Antarabangsa Peptida dan Penyelidikan Protein, 35 (2), 161 - 214.